De acordo com o IPBeja “o Laboratório de Controlo de Qualidade de Águas mantém, desde há largos anos, um estreito relacionamento com entidades particulares, organismos públicos e pessoas singulares, na realização de análises físico-químicas, de acordo com a legislação em vigor.”

Trata-se de um laboratório que tem capacidade de avaliar a qualidade de diferentes tipos de águas, águas para consumo humano, águas de rega, águas balneares e águas residuais e  presta apoio a vários tipos de empresas nacionais e internacionais de diferentes origens, assim como, cooperativas de agricultores e lagares de azeite.

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